Анакопия – расцвет города
Территория Нового Афона была заселена с глубокой древности. На южном склоне Апсарской (более известной как Иверская) горы было обнаружено поселение эпохи неолита (VI-V тысячелетие до н.э.). В IV-II вв. до н.э. здесь существовало поселение городского типа, а с V века н.э. Новый Афон упоминается как Анакопия, которая была вторым по значимости административным и культурным центром Абазгии (Абхазии).
В XI-XIII веках Анакопия успешно развивалась. В X веке здесь был построен храм Симона Кананита, где впоследствии была основана Цхумская (Сухумская) епископская кафедра. В период феодальной раздробленности в XIV-XVII веках Анакопия утрачивает свое политическое и экономическое значение, а во время турецкой оккупации полностью обезлюдела.
Местечко Псырдзха
Во время русско-кавказской войны абхазское население выселилось в Турцию, и местность опустела. Во второй половине XVIII века Анакопия как город перестала существовать и представляла собой развалины, поросшие лесом. Местность стала называться Псырдзха (с абхазского "пихтовый родник") и принадлежала абхазским феодалам из рода Маан.
Новый Афон – религиозный центр и курортный городок
После вхождения Абхазии в состав Российской Империи в 1810 году на побережье возникают новые населенные пункты, местечко Псырдзха получило новую жизнь. Прибывшие в 1875 году из греческого Афона монахи на вершине Афонской горы начали строительство мужского монастыря, а в 1879 году царь Александр II утвердил «Устав Новоафонского монастыря», названного так в честь православного греческого Афона. Вскоре Новый Афон стал крупным религиозным центром на черноморском побережьем Кавказа. В советское время Новый Афон развивался как курорт, превратившись в красивейший курортный город всесоюзного значения.